Nestopia es un interesante emulador de juegos Nintendo el cual incluye numerosas opciones de audio y vídeo, y algunas características ya inusuales como el gestor de FDS (Famicom Disk System), módulo que permitía usar juegos NES en disquetes, por lo que Nestopia es totalmente compatible con las ROM provenientes de estos disquetes, siempre y cuando tengas la BIOS del FDS.

Por si esto fura poco, Nestopia, está preparado para trabajar con más de 140 mappers y cinco clases de procesadores de audio, y tiene un proceso de emulación exacta de los ciclos del reloj, lo cual le concede una gran compatibilidad con la mayoría de los ROM compatibles, incluidos los NFS y FDS.

Además, Nestopia permite al usuario el control total sobre la configuración del juego.